Фонд соціального захисту осіб з інвалідністю є розпорядником бюджетних коштів нижчого рівня, який відповідає за виконання бюджетної програми щодо реабілітації осіб з інвалідністю та дітей з інвалідністю.

За погодженням із Міністерством соціальної політики України Фонд розподіляє бюджетні кошти, які спрямовуються на надання реабілітаційних послуг дітям з інвалідністю, між регіональними органами, які відповідають за розподіл бюджетних коштів між місцевими органами. Механізм розподілу – пропорційно чисельності дітей, що перебувають на обліку та потребують реабілітаційних заходів відповідно до індивідуальних програм реабілітації.

Також Фонд, за погодженням із головним розпорядником бюджетних коштів (Мінсоцполітики) може здійснювати перерозподіл бюджетних коштів між регіональними органами протягом року, а регіональні органи – між місцевими органами на підставі їх звернень.